Mit jeder Abiturfeier verleiht die IGS Gerhard Ertl auch die von ihrem Namensgeber, dem Nobelpreisträger für Physik, Prof. Dr. Gerhard Ertl, gestiftete "Gerhard Ertl-Medaille".

Sie trägt den schriftlichen Zusatz "für herausragende schulische Leistungen in den Naturwissenschaften" und wird seit 2017 vergeben.

Die Preisträger sind:

Christoph Richter, 2017
Yannick Brilmayer, 2018
Philipp Valušek, 2019